房屋租赁合同纳税的方法如下：
税率：房屋租赁合同需要按照合同金额的千分之一缴纳印花税。
缴纳方式：购买印花税票自行贴花，并划线注销。如果合同没有约定租赁期限，只是规定了日租金标准，可以在签订合同时先按定额5元贴花，以后结算时再按实际金额计税，补贴印花。
减免政策：增值税小规模纳税人印花税有减半征收的优惠，一般纳税人则不存在减半优惠。
税率：租金收入需要缴纳5%的营业税。
城市维护建设税：营业税的7%。
教育费附加：营业税的3%。
税率：租金收入需要缴纳20%的个人所得税。
税率：根据房屋用途不同，房产税的税率也有所不同。
非住房租赁：按照租金收入的12%缴纳房产税。
